Ich hab zwar Autotune nicht, aber das kommt drauf an welche Version du hast. Die Artist Version unterstützt keine Einbindung von externen VSTs, das ist erst ab der Pro Version verfügbar, Presonus ist dafür schon heftig kritisiert worden und wird das wahrscheinlich irgendwann ändern, nur nicht in nächster Zeit.
Ansonsten würde es einfach per Drag&Drop aus der Bibliothek gehen indem du den Effekt auf die Spur ziehst. Das PlugIn muss natürlich installiert sein und der Installationsordner für die entsprechenden DLLs muss Studio One bekannt sein (Zu finden unter "Einstellungen"). Wie gesagt, geht natürlich nur, wenn du die Pro Version hast.