Da gibt es mehrere Möglichkeiten.
Als erstes solltest Du alle Steckverbindungen am Orgelcomputer und TOS überprüfen. Falls die aktive Sinusfilterung eingebaut ist, auch dort die Steckverbindungen prüfen.
Der Oktavschieber könnte auch defekt sein (vermute aber, daß es daran nicht liegt): einfach mal mehrfach hin und herbewegen und darauf achten, daß er richtig einrastet. Falls der defekt ist oder nicht richtig eingerastet ist äußert sich das allerdings meist in Verzerrungen auf allen Tönen.
Es könnte sein, daß der TOS defekt ist. Um das zu prüfen reicht eine Abhörleitung (gem. Bauanleitung): Die Töne dann am Stecker des Flachbandkabels abhören.
Bitte vorher mal die Spannungen messen/prüfen:
Drahtbügel (neben Stecker T6) = Minus; Widerstand R2 = Plus → 12 Volt
Drahtbügel (neben Stecker T6) = Plus; Widerstand R1=Minus → 12 Volt
Drahtbügel (neben Stecker T6) = Minus; Pin 1 von IC46 = Plus → 12 Volt
Drahtbügel (neben Stecker T6) = Minus; Pin 16 von IC47 = Plus → 12 Volt
Drahtbügel (neben Stecker T6) = Minus; Pin 1 von IC17 = Plus → 11,5 Volt
Wenn der Fehler nur auf einem Manual auftaucht, könnte einer der IC49/50 auf dem Orgelcomputer defekt sein. Wenn der Fehler auf beiden Manualen auftaucht, wäre es schon verwunderlich wenn alle IC49/50 defekt wären. Falls das tatsächlich der Fall sein sollte, so hast Du ein Problem. Diese Siemens-ICs (SM305) gibt es nicht mehr, und wenn Du sie dennoch irgendwo bekommst, dann sind die teurer als eine gebrauchte Top-Sound.