Diese Antwort kommt zwar reichlich "spät", aber für später Nachlesende (wie mich) macht das keinen Unterschied. Zum "Problem":
Du hast übersehen, dass man in den Rendering-Einstellungen (ganz oben im Render-To-File-Menü) die Optionen über eine Dropdown-Box festlegen kann. Da gibt es die Auswahl zwischen
- Master Mix (selected tracks)
- Stems (selected tracks)
- Master Mix + Stems
- Region Render Matrix
- Selected Media Items
Im vorliegenden Fall wäre die Option "Stems (selected tracks)" die richtige gewesen. Dann wird jede Spur ausgegeben, die zuvor per Mausklick ausgewählt wurde. Wenn ich mich recht erinnere, werden hierbei die Faderstellungen berücksichtigt, d.h. dass ggf. eine Spur sehr leise ausgegeben wird, wenn das im Mix so eingestellt war (post fader). Kann mich aber auch irren. Ausprobieren oder Lesen des betreffenden Abschnitts in der Bedienungsanleitung schafft hier Abhilfe.
Das Ausgabeformat stellt man ca. in der Mitte des Menüs ein. Hier gibt es unter dem Drop-Down-Menü "Output Format" jede Menge Codecs unter denen man wählen kann. Unter den in diesem Thread benannten Bedingungen sollte "WAV" gewählt werden.